matični je arheološki muzej na području Hrvatske, koji se razvio iz nekadašnjeg Narodnog muzeja, najstarije muzeološke ustanove u Zagrebu

u Puli u najvećoj mjeri vrši arheološku djelatnost prikupljanja, obrade i prezentiranja arheološkog materijala i spomenika Istarskog poluotoka.

snovan je s ciljem prikupljanja, čuvanja i prezentiranja arheoloških spomenika Zadra i okolice, a skrbi i o rotondi sv. Donata, u kojoj je Muzej ranije bio smješten,  sklopu bivšeg samostana sv. Nikole te Muzeju ninskih starina u Ninu.

osnovan je s ciljem sakupljanja, proučavanja i prezentiranja spomenika iz razdoblja hrvatskog ranog srednjeg vijeka, a posebno zanimanje usmjereno je na kamene reminiscencije rane hrvatske države od 9. do 12. stoljeća.

najstariji je arheološki muzej u Hrvatskoj. Uz arheološku djelatnost prikupljanja obrade i prezentiranja arheološkog materijala i spomenika, Muzej provodi sustavna arheološka istraživanja na lokalitetima Saloni i Isi (antička Issa), te posjeduje priručnu zbirku i lokalitet Salona, sa zgradom u Solinu – Tusculum, te priručnu zbirku Issa u zgradi Gospine Batarije i istoimeni lokalitet u  gradu Visu.

edini je muzej u Hrvatskoj i u ovom djelu Europe koji je izgrađen na arheološkom  lokalitetu, nad ostacima rimskog hrama posvećenog caru Augustu iz kraja I. st. pr. n. e.